Fra la fine del 1497 e l'inizio del 1498 (quando è Gonfaloniere Giuliano Salviati, secondo quanto riportato nel titolo dell'opera) Savonarola scrive e pubblica il Trattato circa el reggimento e governo della città di Firenze. Il Trattato sul governo di Firenze di Girolamo Savonarola è uno dei testi più importanti e significativi del pensiero italiano del Quattrocento. Paragonato addirittura alla Repubblica di Platone, esso presenta pagine folgoranti contro il tiranno, storicamente Cosimo il Vecchio de’ Medici, e sviluppa una delle concezioni più interessanti della democrazia moderna, incentrandola su un rapporto vitale tra ben vivere civile e vivere cristiano. Destinato ad una vasta fortuna, e ad essere ripreso e riproposto lungo i secoli moderni, esso si impone, oltre che per la profondissima dottrina imperniata su una salda conoscenza di Tommaso, anche per il vigore dello stile e la capacità di coinvolgere il lettore in un discorso lucido e appassionante.